(1)申報進料加工貨物發(fā)生實際進出口時，進出口申報應向海關遞交下列單證： ①進出口貨物報關單（粉紅色）一式4份；②《登記手冊》；③貨物的運單、發(fā)票、裝箱單；④海關認為必要的其他單證。
　　(2)接受查驗。
　　(3)辦理征免稅手續(xù)。
　　(4)海關對進料加工進出口貨物的監(jiān)管規(guī)定。對進料加工進出口貨物，海關區(qū)別情況，按以下規(guī)定進行監(jiān)管：
　　①保稅工廠和備料保稅倉庫。如經(jīng)營單位所屬企業(yè)專門加工出口產(chǎn)品的工廠、車間或經(jīng)營單位本身擁有專門儲存進口料件和加工成品的倉庫，建有健全的專用帳冊、專人管理制度，并具備海關嚴密監(jiān)管條件的，海關可以批準其建立保稅工廠或備料加工保稅倉庫，其料件進口進先予保稅，加工后對實際出口部分所耗進口料件予以免稅，不出口部分予以征稅。
　?、趯诤贤?。對簽有料件進口和加工成品出口的對口合同（包括不同客戶的聯(lián)號合同）的進料加工，經(jīng)主管海關批準，可對其進口料件予以保稅，加工后對實際出口部分所耗進口料件予認免稅。
　　③按比例征稅。對不具備上述①、②項條件的進料加工項下的進口料件，海關根據(jù)《進料加工進口料件征免稅比例表》的規(guī)定，分別按85%或95%作為出口部分免稅，15%或5%作為不能出口部分照章征稅，如實際不能出口部分多于或少于已征比例，經(jīng)海關審核無訛后，分別予以補稅或退稅。
　?、苋~征稅，出口退稅。對有違反海關規(guī)定行為的經(jīng)營單位和加工生產(chǎn)企業(yè)，海關認為必要時，對其進口料件，在進口時先予征稅，待其加工復出口后按其實際所耗的進口料件予以退稅。
　?、輰饪蛻裘赓M提供或者有價提供有關進料加工復出口商品所需進口數(shù)量零星的輔料、包裝物料以及數(shù)量合理、直接用于服裝生產(chǎn)車間的打扣工具和膠針槍等小型易耗性生產(chǎn)工具，海關予以免稅。為簡化手續(xù)，海關憑簽章的合同副本，辦理上述物料的免稅登記手續(xù)，不再核發(fā)《登記手冊》。
　　⑥進料加工項下進口的料件，應自進口之日起1年內(nèi)加工成品返銷出口。如有特殊情況需要延長期限的，應向主管海關申請延期。延期不得超過1年，逾期仍不能復運出口，應按一般貿(mào)易辦理進口手續(xù)。
　?、咭言诤ｊP登記備案的合同，如發(fā)生變更、轉讓、中止、延長、撤銷等情況，經(jīng)營單位應于料件進口前，據(jù)實向主管海關辦理變更或撤銷手續(xù)。
　?、喑隹诤贤幸?guī)定由國外客戶免費或有價提供的原輔料和物料，加工成品后，如有剩余，由經(jīng)營單位提出申請，海關同意后，可以轉入其他出口合同繼續(xù)加工出口，如有內(nèi)銷，應及時補交關稅和進口環(huán)節(jié)稅。
　?、徇M料加工項下的加工成品，原則上不宜以易貨方式出口，但如不能按計劃出口，需采取易貨方式銷往獨聯(lián)體、東歐國家的，應由有關外貿(mào)公司向外經(jīng)貿(mào)主管部門報告，由外經(jīng)貿(mào)主管部門報外經(jīng)貿(mào)部有關司核準，海關憑該司批件驗放。
　?、膺M料加工項下的加工成品，對外成交結匯后應實際離境出口，不允許外商委托我境內(nèi)加工企業(yè)或外貿(mào)經(jīng)營單位將成品直接從我境內(nèi)運往獨聯(lián)體、東歐國家。
　?、线M料加工合同項下免稅進口的料件，應堅持專料專用，不得與國內(nèi)其他料件串換使用。在特殊情況下，因加工出口成品急需，擬使用國內(nèi)同品種、同規(guī)格、同等數(shù)量的原材料頂替進口原材料，并無出售盈利賺取差價等問題，應事先報主管海關核準。
　?、泻ｊP對有色金屬、黑色金屬、棉花紡紗行業(yè)的進料加工，因生產(chǎn)工藝必須與國內(nèi)其他料件串換使用，有以下規(guī)定：
　　一是工藝性料件串換，經(jīng)營單位應經(jīng)主管海關核準，并具備保稅工廠監(jiān)管條件；
　　二是工廠要健全管理制度，按海關要求建立帳冊、記錄投料與產(chǎn)出時間備查。不允許先出口后進口，或不經(jīng)加工在國內(nèi)收購產(chǎn)品出口。不允許倒賣進口料件。
　　三是出口成品中，屬于搭配使用國產(chǎn)原料加工出口部分，如屬應征出口稅的，可予免稅。
　　四是對進料加工出口產(chǎn)品，出口企業(yè)向海關申請進料免稅之前，須持外經(jīng)貿(mào)主管部門的批件，送主管出口退稅稅務機關審核蓋章，并將批件復印留存?zhèn)洳?。產(chǎn)品出口時，企業(yè)應增填一份“出口退稅貨物專用報關單”。對出口企業(yè)報關出口但不實際離境的產(chǎn)品，不予辦理退稅。
　　五是凡經(jīng)營金銀制品的進料加工企業(yè)，所需金銀進口時，應向海關提供中國人民銀行總行，或其授權的分行的批件，否則，海關不予放行。
　　六是根據(jù)外經(jīng)貿(mào)部規(guī)定，下列商品開展進料加工需經(jīng)外經(jīng)貿(mào)部審批，海關憑外經(jīng)貿(mào)部批件及其他有關文件辦理登記備案手續(xù)；
　　a.禁止出口商品;
　　b.軍民通用化學品;
　　c.易制毒化學品;
　　d.重水;
　　e.食糖的進料加工需報外經(jīng)貿(mào)部審批，但不包括以進口白糖為部分原料加工食品、糧食制品復出口的業(yè)務。
　　對以進口白糖（包括砂糖、棉白糖等）為部分原料加工食品、糧食制品復出口的業(yè)務，批量進口在500噸以上，或年進口量超過1000噸的，由有關外貿(mào)總公司、工貿(mào)公司或地方外經(jīng)貿(mào)委報外經(jīng)貿(mào)部審批。
　　限額以內(nèi)的仍按原管理辦法辦理有關手續(xù)。經(jīng)營單位應簽訂進出口對口合同，原料進境后加工復出口期限不得超過半年。
　　f.開展銅及銅基合金、食糖、新聞紙、原油（成品油）、鋼鐵、生鐵、鋅錠、鋁及鋁基合金的進料加工業(yè)務憑外經(jīng)貿(mào)部的批件進行審批管理。