根據(jù)上述職責，肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局設11個內(nèi)設機構：

n（一）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局辦公室。

n協(xié)助局領導組織協(xié)調(diào)機關政務工作，負責擬訂局機關工作制度并督促落實；承擔有關規(guī)范性文件的合法性審核；負責行政復議、行政訴訟應訴工作；負責公文處理、秘書業(yè)務、辦公自動化、新聞報道、機要保密、文印通信、檔案管理、督辦等工作；負責局機關的物業(yè)管理和后勤服務工作。

n（二）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局對外貿(mào)易管理科。

n參與制訂本市對外貿(mào)易發(fā)展戰(zhàn)略和體制改革方案；協(xié)調(diào)供應港澳的配額商品工作；負責推進出口市場多元化戰(zhàn)略的實施；申辦和組織赴國外舉辦展覽會、洽談會；為境內(nèi)的對外經(jīng)貿(mào)交易會、展覽會等提供協(xié)調(diào)服務；負責指導協(xié)調(diào)促進外向型民營企業(yè)發(fā)展的相關工作；負責指導協(xié)調(diào)對臺貿(mào)易；參與農(nóng)產(chǎn)品出口的協(xié)調(diào)管理；組織實施科技興貿(mào)戰(zhàn)略和國際品牌建設；會同有關部門起草有關地方性法規(guī)、規(guī)章草案，負責組織協(xié)調(diào)反傾銷、反補貼、反壟斷、保障措施及其他進出口公平貿(mào)易相關工作，依法組織產(chǎn)業(yè)損害抽查及其他貿(mào)易救濟措施，指導協(xié)調(diào)國外對本市出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施的應訴工作。

n（三）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局機電產(chǎn)品進出口辦公室。

n擬訂全市機電產(chǎn)品進出口的中長期發(fā)展規(guī)劃和年度指導性計劃并組織實施；管理機電產(chǎn)品進口目錄、編報和執(zhí)行機電產(chǎn)品配額的年度進口方案；負責本市機電產(chǎn)品國際招標投標的監(jiān)督、協(xié)調(diào)工作；負責宣傳、貫徹國家機電產(chǎn)品出口政策和財政資助的機電出口產(chǎn)品、技術更新改造和研發(fā)等項目申報、驗收和管理的組織工作；組織科技興貿(mào)專項資金的申報和實施跟蹤管理；負責組織推動本市機電產(chǎn)品、高新技術產(chǎn)品出口國際市場開拓工作；辦理授權的許可事項和相關審核工作。

n（四）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局外商投資促進科。

n負責協(xié)調(diào)和指導本市招商引資、投資促進工作；收集和編印本市招商項目、投資指南，組織實施重大項目對外招商；參與組織重大經(jīng)貿(mào)洽談活動及專項推介活動；定期跟蹤和分析招商引資項目情況、外商投資情況并向上級部門報送有關項目動態(tài)和提出相關建議；負責信息化建設和管理工作，負責網(wǎng)絡資料的收集、更新、網(wǎng)站維護及網(wǎng)上推介、洽談活動。

n（五）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局外商投資管理科。

n參與制訂本市外商投資的發(fā)展戰(zhàn)略，中長期規(guī)劃和年度指導性計劃；依照有關規(guī)定審批或核報國家規(guī)定限額的外商投資項目的立項及其合同、章程以及外商投資項目的變更、終止；核發(fā)外商投資企業(yè)批準證書和進口設備減免稅確認書；參與制訂和實施各類開發(fā)區(qū)的發(fā)展戰(zhàn)略和政策措施，綜合協(xié)調(diào)和指導各類開發(fā)區(qū)的規(guī)劃、建設和管理工作；協(xié)助聯(lián)系和管理駐市政府行政服務中心外經(jīng)貿(mào)窗口工作。

n（六）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局加工貿(mào)易管理科。

n宏觀管理加工貿(mào)易工作，核準管理權限內(nèi)的加工貿(mào)易業(yè)務（含來料加工、進料加工業(yè)務）；編報和監(jiān)督執(zhí)行外商投資企業(yè)涉及國家實行配額許可證管理的進出口商品年度計劃；負責境外設立企業(yè)（機構）和對外經(jīng)濟合作經(jīng)營業(yè)務的核報與宏觀管理；協(xié)調(diào)處理外商投資企業(yè)的投訴和糾紛；承擔進出口貿(mào)易打私工作。

n（七）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局口岸科。

n擬定全市口岸建設發(fā)展規(guī)劃和管理辦法并組織實施；指導縣（市、區(qū)）口岸工作部門的工作；會同有關部門檢查處理口岸各種涉外事件和違法違紀問題；組織和指導開展共建社會精神文明口岸活動。

n（八）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局發(fā)展計劃科。

n負責編報外經(jīng)貿(mào)中長期發(fā)展規(guī)劃和年度進出口指導性計劃及部分進出口商品配額、年度計劃并協(xié)調(diào)組織實施；指導出口基地和出口生產(chǎn)體系項目的建設工作；負責對外經(jīng)濟合作工作和對外援助工作，依法管理和監(jiān)督對外承包工程、對外勞務合作，承辦外派勞務和境外就業(yè)人員權益保護的相關工作。

n（九）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局人事科（加掛老干科牌子）。

n負責局機關及指導直屬單位的機構編制、干部人事管理和培訓教育工作；負責局機關和指導直屬單位離退休人員的管理工作，協(xié)助局關工委做好局機關及直屬單位職工子女青少年的教育工作；負責局機關人員的工資、福利、醫(yī)療、保險和人口與計劃生育的管理工作；負責辦理局機關工作人員出國（赴港澳）政審及局領導的半年多次往返港澳通行證簽證；協(xié)調(diào)和指導市外貿(mào)幼兒園的工作。

n（十）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局財會科。

n負責局機關財務收支和會同有關科室管理機關財產(chǎn)工作；負責外經(jīng)貿(mào)行業(yè)財會信息匯編、分析工作；負責外經(jīng)貿(mào)出口退稅的管理、監(jiān)督，協(xié)助打擊出口騙稅；會同有關部門研究，落實涉及外經(jīng)貿(mào)的外匯、稅收、信貸、價格、保險等政策。

n（十一）肇慶市對外貿(mào)易經(jīng)濟合作局黨委辦公室。

n負責局機關及直屬單位的黨務、紀檢、監(jiān)察工作和政治思想教育工作；負責普法和法制宣傳工作；負責黨風廉政建設、精神文明建設和指導工、青、婦工作。